تحلیل خانواده‌های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از دو روش طبقه‌ای و فراموضعی، برای شناسایی خانواده‌های ژنی با بیان متفاوت به عنوان عامل افتراق بین افراد سالم و بیمار (فنوتیپ) مبتلا به لنفوبلاستیک حاد که دارای کروموزوم BCR/ABL هستند، استفاده شد. در این مطالعه، داده‌های ریزآرایه‌ی یک کارآزمایی بالینی لوسمی لنفوبلاستیک حاد مورد استفاده قرار گرفته و برای تحلیل داده‌ها از نرم‌افزار R استفاده گردید. یافته‌ها: از 200 خانواده ژنی بررسی شده، روش فراموضعی 114 خانواده را که بین جمعیت سالم و بیمار بیان متفاوتی داشتند، شناسایی کرد. در حالی‌که روش طبقه‌ای تنها موفق به شناسایی 30 خانواده ژنی با بیان متفاوت گردید.  نتیجه‌گیری: در هر یک از دو مجموعه خانواده‌های ژنی شناسایی شده به‌وسیله هر روش، تعدادی خانواده‌ی ژنی موثر در بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد دیده می‌شود. بنابراین، اگر چه معرفی روش تحلیلی با توان تشخیصی بالاتر بین افراد سالم و بیمار مبتلا به لنفوبلاستیک حاد، نیازمند به مطالعه‌ای دقیق‌تر است، اما بررسی خانواده‌های ژنی مشترک بین دو روش منجر گردید، آخرین یافته‌های بیولوژیست‌ها تنها با استفاده از این روش‌های آماری به دست آید.